Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCORQ96JN0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms