Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCARF2Q96GP6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms