Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVB12AQ96EY5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms