Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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