Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HGDQ93099 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HGDQ93099 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HGDQ93099 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HGDQ93099 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HGDQ93099 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HGDQ93099 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HGDQ93099 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HGDQ93099 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms