Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTRA1Q92743 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms