Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRUQ92729 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms