Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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RABGGTAQ92696 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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RABGGTAQ92696 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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RABGGTAQ92696 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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RABGGTAQ92696 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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RABGGTAQ92696 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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RABGGTAQ92696 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RABGGTAQ92696 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RABGGTAQ92696 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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