Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NCSTNQ92542 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NCSTNQ92542 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms