Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CASKIN1Q8WXD9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASKIN1Q8WXD9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASKIN1Q8WXD9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASKIN1Q8WXD9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASKIN1Q8WXD9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASKIN1Q8WXD9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASKIN1Q8WXD9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN1Q8WXD9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms