Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC7Q8WUI4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms