Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEIL3Q8TAT5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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