Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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