Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C17orf47Q8NEP4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms