Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HJURPQ8NCD3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms