Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AVL9Q8NBF6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms