Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CLDN19Q8N6F1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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