Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHTF2Q8N3S3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms