Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB43Q86YS6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB43Q86YS6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB43Q86YS6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RAB43Q86YS6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB43Q86YS6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB43Q86YS6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB43Q86YS6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB43Q86YS6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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