Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms