Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HDXQ7Z353 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms