Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms