Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms