Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMARCD3Q6STE5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms