Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LETMD1Q6P1Q0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms