Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms