Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMBOX1Q6NT76 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms