Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRC8EQ6NSJ5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms