Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT80Q6KB66 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms