Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AGAP9Q5VTM2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms