Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms