Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FRMPD1Q5SYB0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms