Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms