Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC93Q567U6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms