Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL12Q53G59 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms