Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC23Q53EV4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms