Protein–RNA interactions for Protein: Q4V348

ZNF658B, Zinc finger protein 658B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF658BQ4V348 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF658BQ4V348 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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