Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSM1Q2NKQ1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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