Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms