Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFA9Q16795 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms