Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDKN3Q16667 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms