Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FXNQ16595 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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