Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLFQ16534 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLFQ16534 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLFQ16534 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLFQ16534 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLFQ16534 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLFQ16534 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLFQ16534 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLFQ16534 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HLFQ16534 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLFQ16534 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLFQ16534 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms