Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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