Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNHIT3Q15649 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms