Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRADDQ15628 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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