Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SS18Q15532 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms