Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE3CQ15386 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms