Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRRQ15256 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms