Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NECTIN1Q15223 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms